Sabe-se que Josephoartigasia monesi habitava a América do Sul, especificamente no que hoje é o Uruguai. Fósseis desta espécie foram descobertos na Formação San José, que remonta às épocas do Plioceno e Pleistoceno, aproximadamente de 4 a 2 milhões de anos atrás.

Durante a época de Josephoartigasia monesi, a região provavelmente apresentava uma mistura de climas subtropicais a temperados. A paisagem teria sido diversa, com uma variedade de ambientes, incluindo pastagens, áreas úmidas e florestadas. Essas condições teriam fornecido ampla vegetação para pastagem e forrageamento, o que é consistente com a dieta herbívora inferida para esta espécie.

Josephoartigasia monesi ocupava o nicho ecológico de um grande herbívoro. Sendo um dos maiores roedores já descobertos, provavelmente desempenhava um papel significativo em seu ecossistema, moldando a dinâmica da vegetação e possivelmente influenciando os habitats de outras espécies contemporâneas. Seu tamanho e provável comportamento social também podem ter fornecido mecanismos de defesa contra predadores.